Torzo kostela sv. Mikuláše se nachází v obytné zástavbě, ve středu obce Sepekov. Jedna z nejdochovalejší částí kostela - vítězný oblouk - je situován mezi čp. 80, 106 a 168, na pozemcích st.parc.č. 37, 38 a 154/1. Vítězný oblouk je vklíněn mezi hospodářské budovy zmíněných čísel popisných. Památková ochrana se vztahuje na torza kamenných zdí a na vítězný oblouk. Památková ochrana se nevztahuje na dotčené pozemky. Původní kostel sv. Mikuláše byl jednolodní s pětiboce uzavřeným presbytářem, který byl zaklenutý křížovou žebrovou klenbou na konzoly. Loď bývala plochostropá, byla osvětlena okny s plaménkovými kružbami. Sakristie se nacházela na severní straně. Z kostela se dochovala pouze část obvodového kamenného zdiva a kamenný vítězný hrotitý oblouk. Kostel se nedochoval, byl rozparcelován na bytové jednotky a počátekm 20. století domy zakomponované do kostela vyhořely. Z původního kostela zůstal jen vítězný hrotitý oblouk, část hrotitého kamenného portálu do sakristie, kamenná konzola se žebrem žeberové křížové klenby presbytáře a část kamenného portálu vstupního otvoru do kostela z jihu. Nejvíce se dochoval vítězný oblouk z lomového kamene. Oblouk je žebrový s hranami v ploše seříznutými a je oboustraně okosen. Nachází se na hranici parcel st.parc.č. 32, 37, 38, 154/1. Kamenný okosený portál do sakristie se dochoval v hospodářské budově domu čp. 106, v jeho podkroví, rovněž tak i kamenné klenební konzoly žebrové křížové klenby. Část portálu hlavního vstupu do kostela se dochovala v nároží domu čp. 105.